O Programa de Pós-Graduação em Educação Profissional e Tecnológica conta atualmente com o curso de Mestrado Profissional em Educação Profissional e Tecnológica em Rede Nacional (ProfEPT), cadastrado na área de Ensino da CAPES, recomendado ao reconhecimento e avaliado com nota 3.

O Mestrado Profissional em Educação Profissional e Tecnológica em Rede Nacional (PROFEPT) tem como objetivo proporcionar formação em educação profissional e tecnológica aos profissionais da Rede Federal de Educação Profissional, Científica e Tecnológica (RFEPCT), visando tanto a produção de conhecimento como o desenvolvimento de produtos, por meio da realização de pesquisas que integrem os saberes inerentes ao mundo do trabalho e ao conhecimento sistematizado.

A oferta em rede envolve instituições associadas de todas as regiões do Brasil, o que inclui 38 Institutos Federais de Educação, Ciência e Tecnologia, o Centro Federal de Educação Tecnológica de Minas Gerais e pelo Colégio Pedro II (chamados de Instituições Associadas). O Instituto Federal do Espírito Santo (Ifes) é a instituição que coordena nacionalmente o ProfEPT, desde a sua criação. No Acre, o Instituto Federal do Acre – Campus Rio Branco é uma Instituição Associada ao ProfEPT desde 2017.